En av de slingrande, genetiskt modifierade anakondaungarna har återfötts och lever vidare i denna del av Anaconda-serien. Den döende mogulen Murdoch skördar nya blodorkidéer och experimenterar med den regenererande nektarn på en ormunge. Den flyr och beger sig ut på ett våldsamt härjningståg. Nu är det upp till herpetologen Amanda och en grupp unga vetenskapsmän att få tag på de eftersökta orkidéerna innan ormen förintar allihop.