I en fängelsecell berättar den framstående advokaten Arthur Eden vad det var som fick honom att ta av sig alla kläder i domstolen och förklara sin kärlek till en 19-årig flicka som är närvarande i rätten. På en liten landsväg undgår Michael Clayton ett bombattentat mot sin bil. Han tillhör byrån Kenner, Bach and Leeden, och hanterar skumraskaffärerna, det som man till varje pris vill dölja. Han har kallats in för att bringa ordning i den röra Arthur Eden ställt till med …