Häxan Marnie upptäcker att även om hon och hennes farmor Aggie stoppade den elake trollkarlen Kalabar, så har hans son Cal nu ärvt rollen som familjens elake. Cal har stulit Aggies magiska böcker och planerar att använda hennes samling med trollformler till att förstöra gränserna mellan den riktiga världen och den spöklika, alternativa världen ”Halloweentown”. Frågan är nu bara om Marnie hinner använda sina snabbt ökande häxkrafter till att stoppa Cal, innan det är för sent