Den sanna historien om japanska enheten nr. 731, från dess början på 30-talet till slutet 1945. Filmen visas ur en ung sjuksköterskas och en japansk officers perspektiv när de bevittnar och deltar i att krigsfångar används som försökskaniner. Delvis spelfilm, delvis dokumentär. Philosophy of a Knife har beskrivits som en av de våldsammaste, brutalaste filmer som någonsin gjorts och med sina dryga fyra timmar så hinner den med en hel del våldsamheter.